‘Game of Clones’ Aplicación de la secuenciación masiva en el estudio de la evolución genómica del melanoma
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comunitat-uji-handle4:10234/200062
REVISTESMetadata
Title
‘Game of Clones’ Aplicación de la secuenciación masiva en el estudio de la evolución genómica del melanomaDate
2022Publisher
Publicacions de la Universitat Jaume I. Servei de Comunicació i Publicacions; Facultat de Ciències de la Salut. Universitat Jaume IISSN
2443-9827Type
info:eu-repo/semantics/articleVersion
info:eu-repo/semantics/publishedVersionSubject
Abstract
Introducción: Tener un mayor conocimiento del inicio de la carcinogénesis a
nivel molecular es esencial para definir nuevos biomarcadores que mejoren el
diagnóstico, tratamiento y pronóstico del paciente. Objetivos: ... [+]
Introducción: Tener un mayor conocimiento del inicio de la carcinogénesis a
nivel molecular es esencial para definir nuevos biomarcadores que mejoren el
diagnóstico, tratamiento y pronóstico del paciente. Objetivos: Definir un protocolo
bioinformático para evaluar el proceso mutacional asociado a la evolución
carcinogénica del melanoma. Método: Se secuenciaron 46 genes clave en la
carcinogénesis en 45 muestras cutáneas procedentes de 15 bloques tumorales
de distintos pacientes. De cada bloque, se biopsiaron muestras de piel sana,
nevus y melanoma. Tras procesar los datos de secuenciación filtrando las variantes
germinales y los artefactos técnicos, se analizó el perfil mutacional y los
signos de selección positiva en cada estadio. Los análisis bioinformáticos se
realizaron con el software R. Resultados: El 73% de las lesiones precursoras
se inician por la adquisición de una mutación oncogénica en BRAF (V600E).
Esta alteración parece estar positivamente seleccionada en estadios tempranos
de la carcinogénesis. Sin embargo, la inactivación del gen supresor tumoral
CDKN2A parece ocurrir exclusivamente en melanomas, siendo una alteración
genética seleccionada en la progresión maligna de las lesiones preneoplásicas.
La firma mutacional procedente de la RUV (SBS7) es el principal causante de
la acumulación de mutaciones somáticas en ambos estadios neoplásicos. Conclusiones:
En el nevus y melanoma se observa la firma mutacional relacionada
con la radiación ultravioleta demostrando así su efecto mutagénico ya en el
estadio preneoplásico. Para la aparición de un melanoma, es necesaria la selección
de clones portadores de mutaciones que favorezcan la proliferación
celular y que permitan escapar al control del ciclo celular. [-]
Introduction: A greater knowledge of the onset of the molecular genetics in carcinogenesis
is essential to define new biomarkers that improve the diagnosis,
treatment and prognosis of the patient. Objectives: To ... [+]
Introduction: A greater knowledge of the onset of the molecular genetics in carcinogenesis
is essential to define new biomarkers that improve the diagnosis,
treatment and prognosis of the patient. Objectives: To define a bioinformatic
protocol to evaluate the mutational process involved in the carcinogenic evolution
of melanoma. Method: We sequenced 46 cancer-relevant genes in 45 skin
samples from 15 tumor blocks from different patients. Samples of healthy skin,
nevus and melanoma were biopsied from each block. After processing the sequencing
data by filtering the germinal variants and technical artifacts, the mutation
profile and signs of positive selection at each stage were analyzed. The
bioinformatic analysis was performed using the software R. Results: 73% of
precursor lesions are initiated by the acquisition of an oncogenic mutation in
BRAF (V600E). This mutation appears to be positively selected in early stages
of carcinogenesis. However, inactivation of the tumor-suppressor gene CDKN2A
appears to emerge exclusively in melanomas as a result of cancer gene selection
in the malignant progression of preneoplastic lesions. The mutational signature
from ultraviolet radiation (SBS7) is the main cause of the accumulation of
somatic mutations in both neoplastic stages. Conclusions: In nevus and melanoma,
the mutational signature related to ultraviolet radiation is observed, thus
demonstrating its mutagenic effect already in the preneoplastic stage. For the
progression of a melanoma is necessary the selection of clones that carry mutations
that favor cell proliferation and allow escaping the control of the cell
cycle. [-]
Is part of
Àgora de salut, 2022, vol. 8Rights
info:eu-repo/semantics/openAccess