Creación de un workflow bioinformático para el análisis de datos en estudios de genoma completo basados en arrays de ADN: asociación e interacción gen-ambiente y diferenciación de expresión genética

Abstract

La Bioinformática ha crecido en los últimos años de forma exponencial junto a la genómica, lo que ha permitido mediante la utilización de herramientas de alto rendimiento, secuenciar y anotar el genoma de forma impensable hace algunos años.

En este trabajo de final de máster, se pueden apreciar dos posibles aplicaciones de la aplicación de técnicas de minería de datos y de cálculos de alto rendimiento a grandes conjuntos de datos. La primera de ellas permite un análisis de genoma completo para determinar si existe algún gen asociado con la diabetes. La segunda de ellas, trata de analizar si la ingesta de tomate es capaz de provocar diferenciación de expresión del genoma humano. Los resultados obtenidos han sido elaborados a partir de datos reales, siendo algunos de ellos publicados recientemente, y el resto analizados en la actualidad.